Le Parco Archeologico di Egnazia comprend plusieurs vestiges de l’ancienne cité de Gnathia, située dans une position privilégiée, à la fois sur la mer et le long de l’ancienne route reliant Bari à Brindisi.

Les remparts remontent probablement à l’époque messapienne. Ils formaient un demi-cercle protégeant la ville du côté des terres, tandis que leur extension le long du littoral est postérieure. À l’extérieur des murs se trouvait la nécropole dite occidentale, d’époque messapienne, avec des tombes appartenant à différentes périodes et rites funéraires. À l’intérieur des murs, on a également découvert des sépultures préromaines.

Parmi les ensembles funéraires mis au jour dans la nécropole, les vases peints connus sous le nom de « céramique d’Egnazia » revêtent une importance particulière. Au pied de l’acropole se trouvait un système d’arcades donnant sur une grande place irrégulière (agora) ainsi que sur le centre monumental de la ville, développé par la suite à l’époque romaine : la basilique civile, le sacellum des divinités orientales, le soi-disant amphithéâtre et le forum.

Le quartier résidentiel ainsi que les structures de production se situaient de l’autre côté de la Via Traiana, l’artère principale de la ville. Le musée, quant à lui, se trouve à l’extérieur des remparts.